上海市中医工作，围绕上海市卫生局和国家中医药管理局中医药事业“十一五”发展规划和工作重点，以维护和增进人民群众健康为目标，把满足人民群众对中医药服务需求作为出发点和落脚点，全面落实科学发展观，以提高中医临床疗效为核心，积极推进继承创新，充分发挥中医药特色优势，把名医、名院、名科“三名”战略做精做细，大力加强中医学科带头人的培养和学科建设力度。通过完善覆盖城乡的中医药体系，积极探索构建中医药预防保健服务体系，加强科研与临床的结合，实施“三名三进”工程，努力实现人人享有基本医疗卫生服务这一目标。
积极开展上海市卫生局重点工作，组建了上海市社区中医药适宜技术推广与应用讲师团，深入到14个区县对社区卫生服务中心医务人员进行辅导讲课，到2007年底，本市228家社区卫生服务中心均有一名以上人员参加师资培训，普及由市卫生局组织编写的《社区常见病证中医药适宜技术（验方）应用百例》一书，要求社区每位医生均要熟练掌握应用。经过各单位申报，经专家评审遴选第三批新增上海市中医医院“董氏指压法治疗婴幼儿吐乳症”疗法等5个项目列为上海市中医药适宜技术推广项目。
加强中医药社区卫生服务示范区创建工作，继上海市闸北区为全国中医药社区卫生服务示范区创建单位之后，徐汇区成为上海市第二个全国中医药社区卫生服务示范区，上海市长宁区、虹口区两区开展新一批全国中医药特色社区卫生服务示范区申报工作。
上海有32个中医专科被列为国家中医药管理局重点专科，17个中医专科（专病）列为上海市中医临床优势专科，完成了10项国家中医药管理局中医药重点研究室申报工作，15家中医医院急诊科、感染科的改扩建工作，浦东区中西医结合传染病临床基地建设均已启动。组织了基于中医特色疗法的理论基础研究中医特异性手法治疗脊柱病“经筋”和“骨错缝”理论基础研究等4个中医研究项目进入国家“973”研究计划，国家“十一五”科技支撑计划中标项目15项创历史最好记录。
上海中医药大学附属龙华医院、曙光医院积极申报国家中医急诊临床基地建设项目，上海市中西医结合医院被批准为国家中医药管理局区县级重点中医院建设单位。本市开展中医医疗质量控制和医院管理年督查工作。全国第三期名老中医学术经验继承班，全国高级中医研修项目人才班（上海市9人）经过3年学习，经考核合格结业。
为贯彻落实吴仪副总理2007年初在全国中医药工作会议上讲话精神，以“治未病”理念为核心，应用健康文化、健康管理、健康保险为一体的“KY3H健康保健模式”，为群众提供自助健康状态信息管理，提供体现中医药特色的个性化预防、保健及诊疗等健康服务。上海市启动了“治未病”健康工程，探索构建中医药特色预防保健服务体系，上海中医药大学附属曙光医院、岳阳中西医结合医院、复旦大学附属华山医院、长宁区北新泾社区卫生服务中心，被国家中医药管理局列为中医治未病试点单位。
