上海合作医疗制度始于1958年，是全国最早起步的省市之一，至今已坚持运行了整整50年。上海合作医疗制度已形成了筹资稳定、补偿合理、管理规范、农民信赖的保障制度，在筹资、补偿、管理等方面都在全国处于领先水平。2007年，上海合作医疗行政村覆盖率100％，参合率98.8％，低保、残疾等人群应保尽保率100％；人均筹资450元，居全国第一，远高于平均水平；门诊平均报销40.8％，住院46.6％，逐年快速增长。
上海合作医疗不仅是一项医疗保障制度，还与救助制度紧密结合，建立大病风险二次补偿机制，彻底解决农民“因病致贫”和“因病返贫”问题。
